本发明涉及一种用于寒冷地区混凝土保护的水性聚氨酯涂料及其制备方法。该水性涂料包括甲组份和乙组份，按重量计，所述甲组份包括：40‑70份水性聚氨酯分散体、0‑20份水性羟基丙烯酸树脂、0‑20份水性氨酸酯树脂、0‑10份水性聚四氟乙烯乳液、0.1‑8份助剂、5‑30份颜料和填料、7‑10份去离子水；所述乙组份为水性异氰酸酯固化剂，加入量为10‑15份。本发明能在低温下正常使用，可防止混凝土在寒冷气候下发生水汽侵蚀、冻融破坏等现象，减缓自然风化速度。