本发明公开了一种大功率缺额下的可控负荷双层调度方法，包括：S1，各负荷聚合商根据预测的温度及用户可调度潜力计算各节点下总可调度潜力，进而进行申报；S2，电力公司根据功率缺额情况制定负荷削减方案，对电网进行最优潮流计算，得到各节点的负荷削减量和最优网损值；S3，负荷聚合商确定优化时间窗和优化周期，每到新的时间窗，更新外界温度和空调的运行状态；S4，对各节点下的负荷根据当前的可调潜力进行聚类分析，得到K个聚类组；S5，运用智能算法以调度偏差最小为目标求解各节点下的调度优化模型；S6，进入新的优化时间窗，重复S3-5，直到调度周期结束。该算法能够有效地减小了配电网的网损，降低了电压越限的可能性。