一种抑制风电光伏不确定性鲁棒优化方法及系统，包括：根据可再生能源发电的类型将微电网系统分解为子系统；根据预先设定的鲁棒模型确定子系统的鲁棒优化方案；将子系统的鲁棒优化方案融合至所述鲁棒模型中计算最优解；基于最优解确定所述微电网系统运行最低成本，最低成本满足了微电网系统稳定运行，可再生能源发电的类型，包括：风机发电和光伏发电。本发明的技术方案通过采用鲁棒优化的方法，将合理的处理微网与云储能之间的利益关系，使微网在稳定运行的基础上达到运行成本最低，最终实现资源共享，配置合理的目的。