本发明提供了一种烟田土壤改良的方法，包括以下步骤：将农作物秸秆与生石灰或石灰氮撒施到待改良烟田中进行深翻耕；对深翻耕后的烟田进行厌氧还原处理。本发明通过施用生石灰或石灰氮提高烟田土壤的pH值，杀灭病原菌，加速秸秆的腐烂分解。同时利用农作物秸秆在厌氧条件下的腐解，提升土壤有机质含量，改良耕作层土壤结构，调控土壤碳氮比及微生物区系，有效控制烟草青枯病、黑胫病等土传病害的发生。实验结果表明，退化烟田经本发明提供的方法改良后，土壤pH值提升10～30％，有机质含量提升5～30％，烟草青枯病和黑胫病等土传病害的发病率降低60～90％。