本发明实施例提供了一种文件合并方法。该方法应用于存储系统中。所述存储系统包括控制器、固态硬盘和机械硬盘。所述控制器读取所述固态硬盘中的第一文件和第二文件。第一文件中保存有第一数据以及所述第一数据的关键字，第二文件中保存有第二数据以及所述第二数据的关键字。所述控制器判断所述第一数据的关键字与所述第二数据的关键字是否相同，当所述第一数据的关键字与所述第二数据的关键字相同时，所述控制器在所述机械硬盘上创建第三文件。然后，所述控制器合并所述第一数据和所述第二数据，并将所述合并后的数据写入所述第三文件。可以提高读文件的效率。