本发明公开了一种光纤传感器的温度补偿方法，属于光纤传感器检测领域。该方法的步骤为：1.在光纤光栅传感器边上安装温度传感器，将其监测的温度信号作为参考温度2.在频域内建立干扰光纤传感器的温度信号，测量信号和真实信号之间的关系式；3.参考实测的温度信号在频域内的能量分布范围设计滤波器的通带和阻带频率；4.基于建立的关系式和设计的滤波器参数，使用频域滤波的方法，从实测信号中剔除温度变化引起的干扰，实现光纤光栅传感器的温度补偿。本发明方法简单，从频域内剔除温度变化对测量结果的影响，精度高，误差小，避免了在时域中进行温度补偿时由于温度传感器和光纤光栅传感器温度场不同，感温速度不同等造成的误差。