本发明提供一种城市轨道交通牵引供电防环流方法和系统。本实施例的方法应用于城市轨道交通牵引供电系统，该系统包括多个牵引变电所，每个牵引变电所包括能馈装置和二极管整流机组，该方法包括：获取二极管整流机组的交流侧电压和能馈装置的直流侧电流；根据二极管整流机组的参数和二极管整流机组的交流侧电压，确定二极管整流机组的空载电压；根据预设目标电压和二极管整流机组的空载电压，确定能馈装置的空载电压；根据能馈装置的直流侧电流、能馈装置的等效内阻和能馈装置的空载电压，确定能馈装置的电压给定值，以防止能馈装置与二极管整流机组之间产生环流。本发明能够避免环流的产生，且能够提高系统的稳定性。