本发明公开了一种麻黄碱的生物制备方法，包括以下步骤：苯甲醛和乙醛、丙酮酸或丙酮酸盐在生物酶的催化作用下在缓冲溶液中反应，纯化，得到光学纯的式(R)‑1‑苯基‑2‑羰基‑3‑丙醇；光学纯的(R)‑1‑苯基‑2‑羰基‑3‑丙醇与甲胺在生物酶的催化作用下在缓冲溶液中反应生成(1R，2S)‑2‑甲氨基‑苯丙烷‑1‑醇，即为麻黄碱。本发明原料供应充足，价格低廉，不需另行制备，试剂价格低廉，产物易重结晶纯化，成本低；酶催化直接生物转化生产麻黄碱，反应条件温和，适合工业化生产；反应条件易控制，操作简便，工艺流程简单，对设备无特殊要求，适于大规模生产。