本专利公开了猪疫苗接种系统，包括漏缝板，所述漏缝板周侧上设有若干个用于定位猪位置的通孔，每个所述通孔用于定位一只猪；设置在所述漏缝板上方的喷水装置，用于清洗所有猪崽及喷射疫苗药剂，所述喷水装置上设有抽水泵，所述抽水泵上设有用于启闭所述抽水泵的控制开关；设置在所述通孔上的注射装置，用于为单只猪崽接种疫苗，所述注射装置上设有气缸，所述气缸上设有用于控制启闭所述气缸的继电器；设置在所述通孔侧壁上的光敏传感器，用于探测位于所述通孔上方一只猪崽的存在；微控制器，用于接收所述光敏传感器传递的信息，以及控制所述控制开关和继电器的启动。更为精确和直接地将疫苗接种到猪崽的粘膜内。