本发明涉及一种电力时间同步系统鲁棒控制的系统及方法，时间同步系统包括至少两个的主时钟装置和从时钟装置，主时钟装置之间通过光纤互连；主时钟装置通过光纤与从时钟装置互联；时间同步系统由主时钟装置接收外部时源信号，保证外部时源信号的安全可靠即保证主时钟装置时源选择的安全可靠，主时钟装置由依次连接的时钟接收单元、时钟单元和输出单元组成，时间同步系统在所述时钟接收单元和时钟单元上设置可靠性判断模块。本发明从时间同步系统信号源入手，通过引入多个外部时源并对输入时源的信号安全性进行判断，杜绝外部不稳定信号的干扰或者恶意篡改的输入时源信号，从而选出最为可靠的时源作为主时钟装置的同步时源，确保主时钟装置时源信号的可靠性。