本发明公开了一种刨去果园根病死树后土壤消毒的方法，包括以下步骤：(1)刨去死树：将发现的死树刨除；(2)树穴消毒：配制浓度为10％的尿素水溶液，根据死树的大小决定灌液量，大树树坑灌15‑20公斤，幼树(小树)树坑灌5‑10公斤；所述大树树坑直径为0.8‑1米，幼树(小树)树坑直径0.5‑0.8米；(3)薄膜封闭：灌液后立即在树坑上方盖塑料膜，防止气体挥发；(4)土施有益菌：处理30天后，去掉薄膜散气后，再施枯草芽孢杆菌和木霉菌，或施枯草芽孢杆菌和em菌。