本发明涉及一种自动调焦电子目镜及系统。包括：镜头、Sensor板、主控单元、接口单元，镜头接收被测目标经前端光学系统一次成的像，其包括聚焦镜片组、聚焦马达及镜片组位置检测单元，Sensor板实现光电转换，将透过镜头的光信号转换成图像信号后输出给主控单元；主控单元，输出控制信号控制所述聚焦马达以驱动所述聚焦镜片组移动，将聚焦镜片组及相应的控制电路集成在电子目镜的内部，由电子目镜内部的主控单元执行聚焦搜索算法，控制聚焦镜片组移动，通过调整像距使其实现自动聚焦。通过本发明，无需移动或者改变前端光学系统(包括不仅限于显微镜，望远镜等)即可实现自动聚焦，提高了聚焦效率和缩短了聚焦时间。