本发明提出一种具有同步控制功能的电源转换器，其包含：变压器、功率开关、开关控制单元、讯号耦合电路、同步整流开关和二次侧控制电路。开关控制单元根据反馈讯号产生操作讯号，并产生一与操作讯号相关的第一同步讯号。讯号耦合电路根据第一同步讯号，耦合产生第二同步讯号。同步整流开关根据同步整流开关讯号而导通或关闭，以进行同步整流。二次侧控制电路根据二次侧位准侦测讯号及第二同步讯号，产生同步整流开关讯号以控制同步整流开关。由此，当功率开关导通，同步整流开关为关闭。另外，本发明还提出一种具有同步控制功能的电源转换器的控制方法。