本发明涉及一种操作实验室自动化系统（10）的方法，其中实验室自动化系统（10）包括：‑许多实验室站（20），‑许多样品容器承载器，其中样品容器承载器适于承载一个或多个样品容器，其中样品容器包括待通过实验室站（20）分析的样品，‑运输机（110），其中运输机（110）适于支撑样品容器承载器，以及‑驱动装置，其中驱动装置适于移动运输机（110）上的样品容器承载器，其中方法包括步骤：‑在实验室自动化系统（10）的初始化期间：‑逻辑地预留运输机（110）上的至少一个缓冲区（30），以及‑在实验室自动化系统（10）的初始化之后：‑在所述至少一个缓冲区（30）中缓冲承载样品容器的样品容器承载器，该样品容器包括等待分析结果的样品，其中根据分析的结果，样品必须进一步处理。