本发明提供了一种两性离子聚合物，其主链为聚硅氧烷结构，侧链含有两性离子，该两性离子聚合物结构稳定，在潮湿、生物降解等环境下具有较常见两性离子聚合物更好的耐久性。该两性离子聚合物能应用在需要抵抗蛋白质附着的医用材料、食品包装材料上，并且具有良好的是使用耐久性。本发明还提供了一种合成该两性离子聚合物的方法，首先采用叔胺基硫醇与带有烯基的聚硅氧烷加成聚合反应得到含大量叔胺基的聚硅氧烷，然后经功能化反应得到聚硅氧烷为主链的两性离子聚合物，该方法快速高效、工艺简便、收率高。