本发明提供了一种香蕉果实颗粒结合淀粉合成酶基因启动子的关键响应元件及其筛选方法，该关键响应元件是以巴西蕉基因组DNA为模板，采用核苷酸序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示的引物，通过PCR方法扩增获得的DNA片段。本发明设计不同长度的香蕉MaGBSSI‑3基因启动子缺失片段，筛选得到MaGBSSI‑3基因启动子的关键相应元件，这为如何有效调控香蕉直链淀粉的合成，以满足食品、医疗、工业等行业对不同含量直链淀粉的需求提供了研究方向，同时为其他植物GBSS基因的研究提供了借鉴。