本发明公开了一种水溶性无毒多色荧光量子点材料的制备方法，将MPA原液加入到Zn(NO3)2溶液，并调节pH值；调节巯基丙酸MPA原液、CuCl2溶液和MnCl2溶液的混合溶液的pH值；之后将混合溶液继续搅拌，并向混合溶液中通入氮气直到反应结束；量子点溶液除氧后，将新鲜制备的NaHSe溶液注入到量子点溶液中加热生长5min，再将混合溶液加热，将Zn前驱体溶液注入到混合溶液中并反应2h。在上述方法的基础上，本发明还通过改变制备条件得到不同尺寸的量子点，从荧光峰位以及荧光强度两方面进行多色Cu,Mn:ZnSe量子点的荧光调控；还制备发白光的Cu,Mn:ZnSe单一量子点，为白光半导体材料的研究打下基础。本发明制备Cu,Mn:ZnSe量子点的方法，过程简单，容易操作，易于推广。