本发明公开微流控芯片的使用方法，微流控芯片为密封腔式结构，内部设置有微流通道，在微流通道的两端分别设置有入液口和出液口，沿入液口到出液口的方向依次设置有镜头孔、背光孔、平行电极、平面波导式梳式电极和电容式介电电极，在微流控芯片侧面还设置有光纤通孔。使用时，微生物检测试液从入液口进入，经过微流通道，从出液口流出。镜头孔与显微高光谱仪相连，并打开背景光源，透过背光孔为显微高光谱仪提供背景光，以实现对微生物显微高光谱图像信息的采集；电容式介电电极、平面波导式梳式电极和平行电极分别连接介电谱测试设备，实现对微生物的介电特性和数量进行检测；光纤通孔与光纤光谱仪相连，实现对微生物的光谱特性进行检测。