本发明涉及一种提高继电保护装置可靠性的方法，在继电保护装置内部保存新文件的存储器中预先植入一种安全程序，当通过外部调试电脑对装置输入新文件时，通过安全程序生成新文件的特征码，安全程序中的病毒特征码与新文件的特征码进行逐个匹配，进行安全性检测判定，把不安全的新文件进行隔离，并将判定结果通过发出调用指令的CPU反馈给调试电脑，调试电脑显示相应的判定结果，提示调试人员操作是否成功。本发明避免恶意程序或文件的植入对装置投运后造成的隐患，进一步提高装置的可靠性，降低运行中发生事故的概率，同时给调试人员对新文件是否安全以及是否输入成功提供重要的指导。