本发明属于天然药物化学，涉及一种从雷公藤植物中分离提取雷公藤甲素的方法。所述方法包括如下步骤：1.溶剂浸提和碱处理；2.去除弱极性物质；和3.柱层析。本发明的方法具有如下优点：在柱层析之前，对雷公藤植物的提取料液进行碱处理，使一些杂质成分进入水层，氯代烷烃层杂质成分减少，在后续柱层析过程中，简化了操作，洗脱速度快，不粘滞；萃取次数减少，溶剂用量大幅减少，从而操作环境变好，并节约成本；无需进行高成本的高效制备液相色谱法进行纯化；雷公藤甲素的提取效率高，提取率可以达到0.0062wt％，且纯度最高达99.9％；由于该方法中均是化工领域的常规操作，便于大规模生产。