本发明实施例公开了一种冷冻水泵组节能控制方法和系统，其中，所述冷冻水泵组节能控制方法包括：计算冷冻水循环系统的分水器与集水器之间的最不利末端压差；通过调节冷冻水泵组的工作转速，将连通所述冷冻水泵组的供回水管路两侧压差调节至所述最不利末端压差；维持所述供回水管路两侧压差于最不利末端压差，根据冷冻水泵组的节能参数控制策略调节所述冷冻水泵组的工作转速和工作台数，以使所述冷冻水泵组的能耗降到最低；其中，所述节能参数包括冷冻水泵组的工作转速、工作台数、功率和效率。本发明的技术方案能够综合调控冷冻水泵组的工作转速与工作台数，增大冷冻水泵组的输出效率，减小冷冻水泵组的输出功率，从而减小冷冻水泵组的输出功耗。