本发明涉及一种高渗特高渗储层的保护剂组合物，所述保护剂组合物由保护剂和填充剂组成，所述填充剂是由重量比为1：(4-30)：(0-40)的600-1000目、300-590目和50-200目的碳酸钙组成，所述保护剂由下式(1)、(2)和(3)所示的结构单元构成。本发明还提供了含有上述组合物的钻井液。本发明还提供了上述钻井液在高渗特高渗储层钻井中的应用。本发明提供的钻井液具有使用简单，环保性能好，储层保护性能卓越，极大的降低了钻井液对高渗特高渗储层的储层损害，带来了客观的经济效益的优点。