本发明提供了一种集成电抗器的感应调控滤波系统及其控制方法，所述系统包括相互连接的新型整流变压器和滤波支路；所述滤波支路包括串联连接的电压源型逆变器及无源调谐支路；所述新型整流变压器的高压侧绕组采用星形接线，直接与电网相连接，低压侧采用延边三角形接线；其中，低压侧延边绕组依次连接整流器和非线性负载，低压侧三角形绕组与延边绕组的交点与滤波支路中的无源调谐支路相连接。本发明可有效抑制新型整流变压器高压侧所产生的谐波电流，由于变压器集成了滤波电抗器，变压器与系统阻抗连接，从滤波支路来看，相当于增大了工业配电网的等效系统阻抗，因此可有效地提高无源调谐支路的抗谐振能力。