本发明公开了一种复配杀菌剂及其制备方法，复配杀菌剂由活性成分、填料和助剂组成，其中，活性成分由三唑类杀菌剂戊唑醇、苯并咪唑类杀菌剂多菌灵组成。可有效防治苹果树皮腐烂病菌、苹果轮纹病菌等枝干真菌性病害。本发明在防治苹果树腐烂病真菌性病害上增效作用显著，X％DW膏剂120天内铲除效果达100％，均明显高于单一制剂；复配制剂速效性和持效性好，作用机制和位点多，能有效延缓病原菌抗药性的发生和发展。此外，本发明的制备工艺简单，成本低，经济效益显著，防病谱广，生物安全性高。