本发明公开了一株微小拟双孢藻及其应用和培养方法，从黄海海水中分离得到的，分类命名为微小拟双孢藻Amphikrikos minutum，于2014年10月22日保藏在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，菌种保藏登记号为CGMCC No. 9815。所述拟双孢藻的采集方法为浮游植物脱网；分离方法采用微吸管吸取、逐级稀释分离及平板涂布法。本发明的有益效果：与其他作为生物柴油原料的藻种相比，本发明的微小拟双孢藻具有很高的油脂含量及生长速率，可以有效降低生物柴油的生产成本。