本发明涉及一种发电机组智能一体式控制器及其控制方法。包括MCU、I/O控制电路、通信单元、人机交互单元、存储单元和电源单元，I/O口控制电路连接至传感器检测单元、执行单元和32位可重定义I/O口；所述传感器检测单元包括机油压力传感器、柴油液位传感器、冷却水温度传感器、发动机起动机转速传感器、柴油机转速传感器、三通道电流传感器、三通道市电电压传感器、三通道发电机电压传感器和发电机转速传感器；所述执行单元包括发电机电压自动调节执行器、发动机起动机、紧急停车按钮、喷油泵执行器、冷却液高水温开关、低机油压力开关、外部锁定开关和断路器合闸与断开控制器。本发明不但可以降低人工成本，且大大提高产品可靠性。