本发明涉及一种多模态生物特征身份认证方法及系统，包括图像获取模块、语音获取模块、主处理模块和存储模块，主处理模块进一步包括：与所述图像获取模块和语音获取模块电连接的控制单元，与所述控制单元电连接的人脸识别单元、语音识别单元和唇形与语音同步检测单元；存储模块分别与所述人脸识别单元和语音识别单元连接；所述控制单元根据所述身份认证装置的当前识别流程将从图像获取模块和语音获取模块接收到的生物特征图像或语音信息发送给人脸识别单元、语音识别单元或唇形与语音同步检测单元进行识别，获得识别结果；本发明的优点在于通过综合人脸、唇形、语音三种生物特征，并将发音特征与唇形特征同步检测进行识别降低了系统识别错误率。