本发明提供了一种高效杀菌灭藻剂及其合成方法，该杀菌灭藻剂主要由环氧氯丙烷、二甲胺、CAB‑35甜菜碱制备而成，其合成方法主要包括以下步骤：将二甲胺加入高位槽中；将环氧氯丙烷、水和CAB‑35甜菜碱投加到反应釜中，在搅拌、40‑48℃条件下滴加二甲胺，滴加时间控制在4‑6小时，在80‑90℃保温3‑5小时，降至室温，放料，即得。本发明所述杀菌灭藻剂具有杀菌效果好，粘泥剥离能力强，低腐蚀，无毒，无污染，无残留等优点，适用范围较宽，操作简单安全，经济适用。