本发明公开了一种基于卫星定位与静力水准测量的分层沉降监测系统及方法，该系统包括基准站、布设在沉降监测区的监测站和与监测站进行通信的监测中心，基准站与监测站进行通信；监测站包括观测墩、安装在观测墩上的第二北斗卫星信号接收机、数据传输单元、多个分层沉降标和静力水准系统，静力水准系统包括多个静力水准仪，每个分层沉降标上均安装有一个静力水准仪，多个静力水准仪中包括一个布设在观测墩上的静力水准仪；该方法包括步骤：一、监测系统设置；二、数据采集与传输；三、数据处理与分析。本发明能有效解决静力水准测量时非稳定工作基点的校测与修正问题，实现了对地质体分层沉降变形的长期、远程和实时监测。