本发明公开了一种GIS同频同相交流耐压试验控制保护方法，包括频率相位保护、高压过压保护和高压闪络保护；首先获取参考电压值和试验电压值并计算频率差和相位差；然后将各电压值、相位差与预设保护定值进行比较；最后判断是否至少有一种保护满足动作条件；如果否，则同频同相电源正常工作；如果是，则断开电源。本发明提供的方法，应用于同频同相交流耐压试验，集保护、控制、测量三大功能于一体；相比于现有控制保护方法，本发明提供的基于频率相位判断的频率相位保护方法和针对隔离断口的过压、闪络保护可以有效避免同频同相交流耐压试验中出现频率相位不一致和隔离断口击穿等突发情况对运行系统、试验设备和人身造成危险。