本发明涉及一种从鱼油精炼副产物中提取富集乙酯型鱼油的方法，以鱼油精炼副产物的皂脚和固脂为原料，采用酸催化乙酯工艺回收皂脚、碱催化乙酯工艺回收固脂，分别经二次三级分子蒸馏和一次尿素包合相结合工艺，富集得到高含量EPA、DHA的乙酯型鱼油。本发明工艺简单，成本低，不仅解决了精炼鱼油中副产物的回收问题，避免了环境污染，而且变废为宝，大大提高了产品的价值，提取得到的乙酯鱼油产品各项理化指标均符合标准，无鱼油酸败味，EPA、DHA的总含量分别提高到78.42%、76.15%，取得较佳的经济效益。