本发明公开了一种虹吸式水库清淤与筛分设备及其使用方法，包括摆动搅吸泥嘴、吸泥状态传感器、水力淤积料筛分设备等，在水库大坝的上游坝坡、坝顶、下游坝坡上，垂直于坝轴线设置有一排镇墩，镇墩上并排安装有吸水管、吸泥管，在水库水面的一排浮船上载有吸泥软管，在一条机动船船头的扒杆吊顶部有吸泥状态传感器，一根钢丝绳穿过与吸泥状态传感器连接的定滑轮，吊起摆动搅吸泥嘴沉于水库库底的淤积层，在下游坝脚处有水力淤积料筛分设备、料场、沉淀池、引水闸、引水渠。该设备运用虹吸原理机动地对库区进行清淤，并给淤积料筛分设备提供动力，把筛分出的砂砾料作为建筑材料，把水引入渠道用于灌溉，是合理地利用水资源进行水环境保护的新设备。