本发明公开了一种磷酸二铵的内染色方法。该方法包括如下步骤：将腐植酸加入至磷酸中并搅拌均匀得到混合原料，将水溶性染色剂和调色剂加入至所述混合物料中，然后与液氨进行反应即得到经内染色的磷酸二铵。本发明具有以下优点：1、以腐殖酸作为主要的磷酸二铵内染色原料，成本低廉。将传统水溶性内染色剂的消耗由吨产品3～6/1000降到0.5/1000以内，吨产品降低成本40元，经济效益显著。2、分三个内染色阶段，“粗底色”、“微底色”和“色相调节”，实现精确调节，产品颜色稳定可靠。3、腐殖酸能与水中的金属离子离合，有利于营养元素向作物传送，并能改良土壤结构，有利于农作物的生长。以腐殖酸替代传统着色剂，解决了传统着色剂的二次环境污染问题，环保意义重大。