本发明公开了一株枯草芽孢杆菌及其在黄瓜枯萎病防治中的应用。本发明提供的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)B201，它的保藏编号为CGMCC No.5786。枯草芽孢杆菌B201能有效防治黄瓜苗期枯萎病。枯草芽孢杆菌B201温室生防效果好、实际应用方法简单、易于操作，对黄瓜苗期枯萎病防效可达58.66％。本发明为生防菌防病机制中的诱导抗性与占位抗病等非拮抗性生防机制的研究提供了重的菌株材料，并为保护地黄瓜无公害生产提供菌种资源。本发明对于黄瓜枯萎病，特别是黄瓜苗期枯萎病的防治具有重大价值。