本发明涉及一种由木质纤维素生物质制备木糖的方法，具体地说是一种综合利用木质纤维素生物质制备木糖的方法。本发明所述的方法通过甲酸和乙酸的混合有机酸酸解木质纤维素生物质，得到戊糖溶液，并将得到的戊糖溶液进行脱色处理后进行除盐，并浓缩、结晶后得到所需的木糖晶体。本发明所述的工艺由于戊糖溶液的生产是通过采用甲酸和乙酸的混合酸液酸解木质纤维素生物质得到的，因此所述戊糖溶液中不含有硫酸根离子，因此在由戊糖制备木糖的工艺中无需额外进行中和处理，也避免了中和后处理困难的问题，而且无酸碱消耗，节能且无污染。