本发明公开了一种中空纤维膜组件灌封系统及其灌封方法，灌封系统包括：灌封介质罐、静态在线混料器、PLC可编程控制器、触摸屏、灌封介质计量系统、分散台、真空泵和清洗溶剂罐；封装方法包括：添加灌封介质→灌封系统的预加热→灌封介质搅拌脱泡→灌封介质计量→灌封介质在线混合→灌封组件→灌封介质分散→清洗灌封系统。本发明工艺过程采用自动化控制，灌封过程全密封，组件灌封不受环境温度影响；且具有能耗低、稳定性高、使用寿命长、无需更换部件就可以灌封不同规格组件封装等优点。