本发明涉及用于加氢脱蜡工艺的双功能催化剂及其制备方法，所述催化剂具有提高的异构化选择性，更具体而言，本发明涉及这样的双功能催化剂及其制备方法，该催化剂的特征在于使用具有受控相变程度的EU-2沸石作为具有酸性位点的催化剂载体。通过控制EU-2的合成参数，相变程度受控的EU-2沸石包含：预定量的由诸如方晶石和石英的EU-2晶体相转变而来的材料。在正十六烷的加氢异构化反应过程中，根据本发明的载有金属的双功能催化剂提高了异构化过程而不是裂解反应的选择性。因此，所述双功能催化剂可广泛地用作用于诸如润滑油基础油和柴油的脱蜡工艺的催化剂。