本发明公开了一种从南极磷虾中提取虾青素一酯的方法，步骤如下：取干的南极磷虾，加入正己烷，搅拌提取过滤，滤液旋转蒸发去除正己烷，得红色虾油；向红色虾油中加丙酮溶解，过滤得丙酮提取液，旋转蒸发去除丙酮，得含虾青素一酯的红色虾油样品，用石油醚溶解，备用；取层析柱，装柱、上样、洗脱得红色条带，旋转蒸发去除溶剂，即得虾青素一酯。本发明的从南极磷虾中提取虾青素一酯的方法，采用正己烷和丙酮提取、柱层析制备虾青素一酯，溶剂用量少，工艺过程简单易行，为南极磷虾中虾青素一酯的提取制备提供了技术参考。