本发明涉及一种高纯双氧水的连续制备方法，该方法以不含稳定剂的工业级双氧水为原料，包括依次且连续进行的下列步骤：（1）调节双氧水浓度，并控制双氧水的温度在0~15℃之间；（2）使双氧水依次以300~450L/H的流速通过大孔吸附树脂吸附柱、阳离子交换柱以及阴离子交换柱后，用0.1微米的滤芯循环过滤，得到初级提纯双氧水；（3）使初级提纯双氧水依次以300~450L/H的流速通过孔径为1~5纳米的纳滤膜、硼硅树脂吸附柱、反渗透膜以及混床树脂后，用0.1微米的滤芯循环过滤，即得。本发明可生产出可直接用于不含添加剂且存储稳定性好的高纯过氧乙酸溶液的制备的高纯双氧水，且生产成本较低。