本发明公开一种流化床富集装置及其使用方法。该流化床富集装置包括一料液罐、一第一管道、一富集单元、一第二管道、一废液储槽和一动力泵；该富集单元包括一装有富集材料的富集容器、一用于密封富集容器开口的密封盖，该密封盖设置入口和出口；该料液罐与该第一管道入口连通，该第一管道出口通过该密封盖入口与该富集容器连通，该第一管道出口的端口位于该富集容器下部；该第二管道入口通过该密封盖出口与该富集容器连通，该第二管道入口的端口位于该富集容器的上部；该第二管道出口与该废液储槽连通；该动力泵用于使该料液罐中样品依次流经该第一管道和该第二管道。该流化床富集装置能够快速、均匀、高效地富集目标物。