本发明提供了一种PID参数整定方法及系统，在工况系统识别出当前被控对象的数学模型后，得到数学模型的参数，监控人员根据实际的工况对控制对象的数学模型的误差做出大致判断，然后设定相应的模型误差值，并根据所述模型误差值判断是采用微调还是采用粗调，若判定为采用粗调，则输入模型参数和模型误差值，若判定为采用微调，则输入模型参数和调节的单位微调量的个数；然后相应的计算单元对应的计算最佳控制器参数，最后根据被控对象的数学模型的参数和最佳控制器参数，计算理想PID控制器参数。本发明能在不重新设计控制器的情况下，自动处理实际控制对象的不确定性，在性能和鲁棒性之间进行最佳折中，达到更好的控制效果。