本发明公开了一种降低烟草中吡虫啉和啶虫脒残留的方法，包括：将烟草采用纸箱包装，堆积厚度为26～72cm，堆积密度为0.20～0.34g/cm3；将烟箱置于输送速度为0.02～0.3m/s的传送装置上，并接受电子加速器产生的电子束或X射线辐照，所述电子加速器的能量为5～10MeV，束流为0.3～20mA，束功率为10～20kW，最大扫描宽度为100cm，扫描频率为5～15Hz，辐照剂量为1～10kGy，工作温度设定在5～35℃，烟箱两次通过电子加速器扫描窗接受辐照，辐照时烟箱中心距离所述电子加速器的扫描窗40～60cm；工作时环境湿度限制在不大于60%。