本发明公开了一种高性能水性涂料用的聚酯树脂，主要是由以下重量百分比含量的原料经熔融缩聚反应得到：多元醇：25~70%，支化剂：1~20%，芳香多元酸：20%～35%，脂肪多元酸：5%～20%，酸解剂：3%～15%，酯化催化剂：0.005%～0.15%。本发明还公开了该聚酯树脂的制备方法。本发明提供的聚酯树脂粘度低、存储稳定性好，采用的工艺简单易行，用于聚酯树脂/水性氨基树脂固化体系中，且制备的水性涂料具有优异的耐水性能、高光泽和优异的机械性能。