本发明提供了一种新型离子液体硅胶毛细管整体柱固定相的制备方法，主要采用溶胶-凝胶和金纳米粒子表面功能化技术制备新型离子液体硅胶毛细管整体柱固定相。本发明利用金纳米粒子对含巯基、氨基、氰基的配体有强亲和性的特点，同时结合金纳米粒子、离子液体和硅胶整体柱的优良性质，制备出的离子液体硅胶毛细管整体柱具有选择性好、柱效高、制备简单以及应用范围广泛等优点。带正电的咪唑环与分析物具有多种相互作用，包括疏水作用、离子交换作用、π-π作用、偶极作用以及弱亲水作用，同时还具有氢键作用等多重作用机理。因此可应用于疏水中性化合物、碱性有机化合物、极性化合物和无机阴离子的分离分析。本发明可用作毛细管电色谱或毛细管液相色谱固定相，在分离科学领域具有很好的应用潜力。