本发明公开了一种利用双菌多酶进行废纸脱墨的方法，涉及造纸工业中的废纸生物脱墨技术。该方法包括以下步骤：(1)两种裂褶菌混合进行液体深层发酵培养；(2)检测混合发酵液中纤维素酶、木聚糖酶和脂肪酶的活力和裂褶菌多糖的含量；(3)碎解废纸；(4)将经适当稀释的粗酶液加入到碎解后的废纸浆中反应；(5)反应后的废纸浆进行浮选脱墨。经本发明脱墨后的废纸浆，浆料滤水性能明显改善，纸张强度略有增加，白度提高，残余油墨量下降明显；并且与目前使用复合酶制剂的方法相比，可减少浮选表面活性剂的用量，降低脱墨成本和脱墨废水污染。由此可见，本发明为造纸工业实现高效清洁脱墨提供新的工艺方法。