本发明公开了一种同步以太网架构和时钟同步控制方法，使用M-LVDS方案设计背板拓扑结构，每个业务板卡都通过多路复用器对同步时钟的选择，使用了锁相环对同步时钟进行处理，使得机架中的所有业务端口即可以作为同步以太网的主端口，也可以作为同步以太网的从端口。使用本发明的机架式同步以太网架构和时钟同步方法，取消了专门的时钟板卡进行处理，降低了设备成本；提高了时钟源选择的灵活性，更有利于实现可靠的时钟恢复、时钟同步、时钟消抖和同步时间戳的传递。