本发明公开了一种Java Card中应用补丁程序的方法及装置，以避免更新应用程序所造成的用户数据丢失，提高开发效率。该方法为：判断Java Card应用程序的补丁程序的状态是否为激活状态，若确定补丁程序的状态为激活状态，则获取所述补丁程序的唯一标识，并根据所述补丁程序的唯一标识获取相应的补丁程序并运行，若确定补丁程序的状态为未激活状态，则运行所述原应用程序。该方法能够有效地避免更新应用程序所造成的用户数据丢失，提高开发效率。本发明同时公开了一种Java Card中应用补丁程序的装置。