本发明公开了一种微管结合蛋白及其编码基因与应用。本发明公开的微管结合蛋白，是如下(a)或(b)的蛋白质：(a)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质；(b)将序列1的氨基酸序列经过一至十个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与抑制MCAK蛋白解聚微管的活性相关的由序列1衍生的蛋白质。本发明的蛋白通过与EB1和MCAK的相互作用参与微管正向末端动态性的调控，通过抑制MCAK蛋白的微管解聚活性来稳定微管。将所述微管结合蛋白基因的小干扰RNA的编码基因导入宿主，MCAK的微管定位将受到严重影响。本发明的蛋白及其编码基因将在医学及制药领域发挥重要作用，应用前景广阔。