本发明提供一种结合高浓度有机酸废水处理、微生物合成PHA和污水厂剩余污泥处置三者的技术特点、实现高浓度含有机酸废水处理、减少剩余污泥产量的利用水处理剩余污泥合成聚羟基烷酸脂的方法。方法步骤包括：活性污泥接种；污泥活性恢复及生物选择阶段；驯化积累PHA；排出一批次的富含PHA的活性污泥进行PHA提取。本发明最主要的特点是简单快速，每一批接种污泥的驯化过程不超过15-30天；装置简单，只通过一个SBR反应器即可实现，驯化过程和积累过程同步；对于城市污水厂二沉池污泥，一般PHA含量占细胞干重可达30％以上；运行稳定性较好，通过设置了一个保证反应器稳定的厌氧选择工艺段，来抑制丝状菌的繁殖防止污泥膨胀崩溃。