本发明公开了一种辅助筛选抗白粉病小麦的方法及其专用引物。本发明所提供的辅助筛选抗白粉病小麦的引物对，是引物对Xbarc79-1和Xwmc288-1中的至少一对；所述引物对Xbarc79-1的脱氧核糖核苷酸序列如序列表中序列1和序列2所示；所述引物对Xwmc288-1的脱氧核糖核苷酸序列如序列表中序列3和序列4所示。本发明还提供了抗白粉病基因的分子标记Xbarc79和Xwmc288，所述分子标记Xbarc79的脱氧核糖核苷酸序列如序列表中序列5所示，所述分子标记Xwmc288的脱氧核糖核苷酸序列如序列表中序列6所示。本发明的引物对和分子标记将在小麦抗病育种中发挥重要作用。